6月2日晚间，巴列维国王应柏林社民党市长阿尔伯茨之邀，前往德国歌剧院观看歌剧魔笛。警方把上千示威学生用栅栏隔离在歌剧院对面。在巴列维国王到达歌剧院现场时，示威者虽然向他们投掷番茄和涂料袋，但由于距离相隔200米，并未能击中任何目标。在示威的人群中，有当时还是律师后来出任德国内政部长的席利和他的太太。

歌剧魔笛开演之后，警察在市长示意之下进行清场，警方首先放走再次大打出手的伊朗打手，随后采取所谓“烤香肠”战术，即突然中路袭击示威学生，迫使学生往两侧和后面撤离，跨过警戒栏杆的学生则遭到警方高压水龙头和警棍的袭击。

<<法兰克福汇报>>事后的报道称，当时警方根本没有遇到“紧急情况”需要采取如此极端手段，而警方当时手法之残酷，只能从“有关法西斯和半法西斯国家的报道中读到”。

此前，警方通过扩音器散布有警察被刺伤的消息，此消息事后被证明为子虚乌有。但当时的气氛却因此而愈发紧张。最近出版的一本书籍认为，警方的这则广播挑起了在场警员的情绪，这也说明了为什么当晚普通警察会如此凶暴。事后证明，在警方开始向学生冲击之前，没有播放过要求学生撤离的请求。

晚间20/30分左右，一群逃离到歌剧院300米外的Krummerstr. 66/67号院内的学生遭到追捕警察的殴打，混乱中突然发生枪击。首次参加游行的柏林自由大学学生奥纳索格(Benno Ohnesorg)被击中，开枪者是身穿便衣的柏林刑事警官库拉斯(Karl-Heinz Kurras)。

尽管现场有包括至少六名记者的多人在场，但无人确切看见枪击发生经过。而警官库拉斯本人的说法则前后矛盾，开始说是自卫还击，后来则改成无意误伤。他声称有人用刀向他进行威胁，又声称开枪警告误击中奥纳索格。但事后被捕的示威者中无人持刀，另外也无人证明当时他曾经鸣枪警告。尸体检查报告显示，奥纳索格在被枪击之前曾经被警察殴打。还有证人作证，在奥纳索格临死前最后一句话是，“请别开枪”。

案发后在现场附近的一名医生做证，尽管他出示医生证明，当时警方拒绝他为奥纳索格救护。一个小时后，迟迟到来的救护车才把奥纳索格送进医院，奥纳索格已经不治身亡。

此后，奥纳索格颅骨被子弹击中处的骨头被人取出，伤口被人缝合，究竟是谁的作为，这至今还是无人可以解开的迷。

6月3日1时，柏林市长阿尔伯茨还发表公告称，柏林警方是在忍无可忍的情况下，经过他的同意被迫对学生和示威者采取激烈行动。柏林市政府随后禁止学生集会，警方也将柏林自由大学校园包围。大学生6月3日悼念奥纳索格的活动被禁止。

6月8日在汉诺威为奥纳索格举行的葬礼上，有将近上万人参加。

6月2日事件后，斯皮林格出版社旗下的包括<<图片报>>在内的媒体基本站在市政府和警方立场，对学生进行攻击。而<<明镜周刊>>，<<时代报>>以及<<法兰克福评论报>>则开始仔细调查事件经过，并且传递知识界支持学生行动的声音。

在两轮审讯之后，开枪打死大学生奥纳索格的警察库拉斯被法庭判处无罪释放。1967年9月，柏林市长阿尔伯茨(Heinrich Albertz)引疚辞职，和他一起下台的还有柏林内政部长和警察总监。有证据证明，警方对6月2日晚间德国歌剧院前的清场早有预谋。

奥纳索格之死直接催生了两个左翼恐怖组织，“六月二日行动”(Bewegung 2. Juni)和红军旅(RAF)都公开声明奥纳索格之死是他们成立的导火索。数月之后，红军旅的第一批骨干巴德(Bader)，恩斯林(Ensslin)在法兰克福超市纵火，从此开始了针对现政府和社会知名人物的暴力袭击行动。

而当年参与学生示威的席利，则因为出任奥纳索格父亲的律师而一举成名，由此走上政坛，并最后成为德国联邦内政部长。